用PMML实现机器学习模型的跨平台上线

用PMML实现机器学习模型的跨平台上线在机器学习用于产品的时候,我们经常会遇到跨平台的问题。比如我们用Python基于一系列的机器学习库训练了一个模型,但是有时候其他的产品和项目想把这个模型集成进去,但是这些产品很多只支持某些特定的生产环

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    在机器学习用于产品的时候,我们经常会遇到跨平台的问题。比如我们用Python基于一系列的机器学习库训练了一个模型,但是有时候其他的产品和项目想把这个模型集成进去,但是这些产品很多只支持某些特定的生产环境比如Java,为了上一个机器学习模型去大动干戈修改环境配置很不划算,此时我们就可以考虑用预测模型标记语言(Predictive Model Markup Language,以下简称PMML)来实现跨平台的机器学习模型部署了。

1. PMML概述

    PMML是数据挖掘的一种通用的规范,它用统一的XML格式来描述我们生成的机器学习模型。这样无论你的模型是sklearn,R还是Spark MLlib生成的,我们都可以将其转化为标准的XML格式来存储。当我们需要将这个PMML的模型用于部署的时候,可以使用目标环境的解析PMML模型的库来加载模型,并做预测。

    可以看出,要使用PMML,需要两步的工作,第一块是将离线训练得到的模型转化为PMML模型文件,第二块是将PMML模型文件载入在线预测环境,进行预测。这两块都需要相关的库支持。

2. PMML模型的生成和加载相关类库

    PMML模型的生成相关的库需要看我们使用的离线训练库。如果我们使用的是sklearn,那么可以使用sklearn2pmml这个python库来做模型文件的生成,这个库安装很简单,使用”pip install sklearn2pmml”即可,相关的使用我们后面会有一个demo。如果使用的是Spark MLlib, 这个库有一些模型已经自带了保存PMML模型的方法,可惜并不全。如果是R,则需要安装包”XML”和“PMML”。此外,JAVA库JPMML可以用来生成R,SparkMLlib,xgBoost,Sklearn的模型对应的PMML文件。github地址是:https://github.com/jpmml/jpmml。

    加载PMML模型需要目标环境支持PMML加载的库,如果是JAVA,则可以用JPMML来加载PMML模型文件。相关的使用我们后面会有一个demo。

3. PMML模型生成和加载示例

    下面我们给一个示例,使用sklearn生成一个决策树模型,用sklearn2pmml生成模型文件,用JPMML加载模型文件,并做预测。

    完整代码参见我的github:https://github.com/ljpzzz/machinelearning/blob/master/model-in-product/sklearn-jpmml

    首先是用用sklearn生成一个决策树模型,由于我们是需要保存PMML文件,所以最好把模型先放到一个Pipeline数组里面。这个数组里面除了我们的决策树模型以外,还可以有归一化,降维等预处理操作,这里作为一个示例,我们Pipeline数组里面只有决策树模型。代码如下:

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
%matplotlib inline
import pandas as pd
from sklearn import tree
from sklearn2pmml.pipeline import PMMLPipeline
from sklearn2pmml import sklearn2pmml

import os
os.environ["PATH"] += os.pathsep + 'C:/Program Files/Java/jdk1.8.0_171/bin'

X=[[1,2,3,1],[2,4,1,5],[7,8,3,6],[4,8,4,7],[2,5,6,9]]
y=[0,1,0,2,1]
pipeline = PMMLPipeline([("classifier", tree.DecisionTreeClassifier(random_state=9))]);
pipeline.fit(X,y)

sklearn2pmml(pipeline, ".\demo.pmml", with_repr = True)

    上面这段代码做了一个非常简单的决策树分类模型,只有5个训练样本,特征有4个,输出类别有3个。实际应用时,我们需要将模型调参完毕后才将其放入PMMLPipeline进行保存。运行代码后,我们在当前目录会得到一个PMML的XML文件,可以直接打开看,内容大概如下:

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" standalone="yes"?> <PMML xmlns="http://www.dmg.org/PMML-4_3" version="4.3"> <Header> <Application name="JPMML-SkLearn" version="1.5.3"/> <Timestamp>2018-06-24T05:47:17Z</Timestamp> </Header> <MiningBuildTask> <Extension>PMMLPipeline(steps=[('classifier', DecisionTreeClassifier(class_weight=None, criterion='gini', max_depth=None, max_features=None, max_leaf_nodes=None, min_impurity_decrease=0.0, min_impurity_split=None, min_samples_leaf=1, min_samples_split=2, min_weight_fraction_leaf=0.0, presort=False, random_state=9, splitter='best'))])</Extension> </MiningBuildTask> <DataDictionary> <DataField name="y" optype="categorical" dataType="integer"> <Value value="0"/> <Value value="1"/> <Value value="2"/> </DataField> <DataField name="x3" optype="continuous" dataType="float"/> <DataField name="x4" optype="continuous" dataType="float"/> </DataDictionary> <TransformationDictionary> <DerivedField name="double(x3)" optype="continuous" dataType="double"> <FieldRef field="x3"/> </DerivedField> <DerivedField name="double(x4)" optype="continuous" dataType="double"> <FieldRef field="x4"/> </DerivedField> </TransformationDictionary> <TreeModel functionName="classification" missingValueStrategy="nullPrediction" splitCharacteristic="multiSplit"> <MiningSchema> <MiningField name="y" usageType="target"/> <MiningField name="x3"/> <MiningField name="x4"/> </MiningSchema> <Output> <OutputField name="probability(0)" optype="continuous" dataType="double" feature="probability" value="0"/> <OutputField name="probability(1)" optype="continuous" dataType="double" feature="probability" value="1"/> <OutputField name="probability(2)" optype="continuous" dataType="double" feature="probability" value="2"/> </Output> <Node> <True/> <Node> <SimplePredicate field="double(x3)" operator="lessOrEqual" value="3.5"/> <Node score="1" recordCount="1.0"> <SimplePredicate field="double(x3)" operator="lessOrEqual" value="2.0"/> <ScoreDistribution value="0" recordCount="0.0"/> <ScoreDistribution value="1" recordCount="1.0"/> <ScoreDistribution value="2" recordCount="0.0"/> </Node> <Node score="0" recordCount="2.0"> <True/> <ScoreDistribution value="0" recordCount="2.0"/> <ScoreDistribution value="1" recordCount="0.0"/> <ScoreDistribution value="2" recordCount="0.0"/> </Node> </Node> <Node score="2" recordCount="1.0"> <SimplePredicate field="double(x4)" operator="lessOrEqual" value="8.0"/> <ScoreDistribution value="0" recordCount="0.0"/> <ScoreDistribution value="1" recordCount="0.0"/> <ScoreDistribution value="2" recordCount="1.0"/> </Node> <Node score="1" recordCount="1.0"> <True/> <ScoreDistribution value="0" recordCount="0.0"/> <ScoreDistribution value="1" recordCount="1.0"/> <ScoreDistribution value="2" recordCount="0.0"/> </Node> </Node> </TreeModel> </PMML>

    可以看到里面就是决策树模型的树结构节点的各个参数,以及输入值。我们的输入被定义为x1-x4,输出定义为y。

    有了PMML模型文件,我们就可以写JAVA代码来读取加载这个模型并做预测了。

    我们创建一个Maven或者gradle工程,加入JPMML的依赖,这里给出maven在pom.xml的依赖,gradle的结构是类似的。

 <dependency> <groupId>org.jpmml</groupId> <artifactId>pmml-evaluator</artifactId> <version>1.4.1</version> </dependency> <dependency> <groupId>org.jpmml</groupId> <artifactId>pmml-evaluator-extension</artifactId> <version>1.4.1</version> </dependency>

    接着就是读取模型文件并预测的代码了,具体代码如下:

import org.dmg.pmml.FieldName; import org.dmg.pmml.PMML; import org.jpmml.evaluator.*; import org.xml.sax.SAXException; import javax.xml.bind.JAXBException; import java.io.FileInputStream; import java.io.IOException; import java.io.InputStream; import java.util.HashMap; import java.util.LinkedHashMap; import java.util.List; import java.util.Map; /** * Created by 刘建平Pinard on 2018/6/24. */ public class PMMLDemo { private Evaluator loadPmml(){ PMML pmml = new PMML(); InputStream inputStream = null; try { inputStream = new FileInputStream("D:/demo.pmml"); } catch (IOException e) { e.printStackTrace(); } if(inputStream == null){ return null; } InputStream is = inputStream; try { pmml = org.jpmml.model.PMMLUtil.unmarshal(is); } catch (SAXException e1) { e1.printStackTrace(); } catch (JAXBException e1) { e1.printStackTrace(); }finally { //关闭输入流 try { is.close(); } catch (IOException e) { e.printStackTrace(); } } ModelEvaluatorFactory modelEvaluatorFactory = ModelEvaluatorFactory.newInstance(); Evaluator evaluator = modelEvaluatorFactory.newModelEvaluator(pmml); pmml = null; return evaluator; } private int predict(Evaluator evaluator,int a, int b, int c, int d) { Map<String, Integer> data = new HashMap<String, Integer>(); data.put("x1", a); data.put("x2", b); data.put("x3", c); data.put("x4", d); List<InputField> inputFields = evaluator.getInputFields(); //过模型的原始特征,从画像中获取数据,作为模型输入 Map<FieldName, FieldValue> arguments = new LinkedHashMap<FieldName, FieldValue>(); for (InputField inputField : inputFields) { FieldName inputFieldName = inputField.getName(); Object rawValue = data.get(inputFieldName.getValue()); FieldValue inputFieldValue = inputField.prepare(rawValue); arguments.put(inputFieldName, inputFieldValue); } Map<FieldName, ?> results = evaluator.evaluate(arguments); List<TargetField> targetFields = evaluator.getTargetFields(); TargetField targetField = targetFields.get(0); FieldName targetFieldName = targetField.getName(); Object targetFieldValue = results.get(targetFieldName); System.out.println("target: " + targetFieldName.getValue() + " value: " + targetFieldValue); int primitiveValue = -1; if (targetFieldValue instanceof Computable) { Computable computable = (Computable) targetFieldValue; primitiveValue = (Integer)computable.getResult(); } System.out.println(a + " " + b + " " + c + " " + d + ":" + primitiveValue); return primitiveValue; } public static void main(String args[]){ PMMLDemo demo = new PMMLDemo(); Evaluator model = demo.loadPmml(); demo.predict(model,1,8,99,1); demo.predict(model,111,89,9,11); } }

    代码里有两个函数,第一个loadPmml是加载模型的,第二个predict是读取预测样本并返回预测值的。我的代码运行结果如下:

target: y value: {result=2, probability_entries=[0=0.0, 1=0.0, 2=1.0], entityId=5, confidence_entries=[]}
1 8 99 1:2
target: y value: {result=1, probability_entries=[0=0.0, 1=1.0, 2=0.0], entityId=6, confidence_entries=[]}
111 89 9 11:1

    也就是样本(1,8,99,1)被预测为类别2,而(111,89,9,11)被预测为类别1。

    以上就是PMML生成和加载的一个示例,使用起来其实门槛并不高,也很简单。

4. PMML总结与思考

    PMML的确是跨平台的利器,但是是不是就没有缺点呢?肯定是有的!

    第一个就是PMML为了满足跨平台,牺牲了很多平台独有的优化,所以很多时候我们用算法库自己的保存模型的API得到的模型文件,要比生成的PMML模型文件小很多。同时PMML文件加载速度也比算法库自己独有格式的模型文件加载慢很多。

    第二个就是PMML加载得到的模型和算法库自己独有的模型相比,预测会有一点点的偏差,当然这个偏差并不大。比如某一个样本,用sklearn的决策树模型预测为类别1,但是如果我们把这个决策树落盘为一个PMML文件,并用JAVA加载后,继续预测刚才这个样本,有较小的概率出现预测的结果不为类别1.

    第三个就是对于超大模型,比如大规模的集成学习模型,比如xgboost, 随机森林,或者tensorflow,生成的PMML文件很容易得到几个G,甚至上T,这时使用PMML文件加载预测速度会非常慢,此时推荐为模型建立一个专有的环境,就没有必要去考虑跨平台了。

    此外,对于TensorFlow,不推荐使用PMML的方式来跨平台。可能的方法一是TensorFlow serving,自己搭建预测服务,但是会稍有些复杂。另一个方法就是将模型保存为TensorFlow的模型文件,并用TensorFlow独有的JAVA库加载来做预测。

    我们在下一篇会讨论用python+tensorflow训练保存模型,并用tensorflow的JAVA库加载做预测的方法和实例。

 

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