转录调控必知数据库ENCODE,介绍及使用方法[通俗易懂]

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按照上图的展示,目前的ENCODE通过多种测序数据来反应基因组变化的过程,分别是通过

  • Hi-C 来观察三维基因组

  • ATAC-seq/chip-seq 研究基因的转录调控

  • 甲基化芯片来研究甲基化的调控作用

  • RNA-seq 来研究基因表达的变化

  • RIP-seq 研究在转录后调控的信息

我们可以通过ENCODE数据库来检索自己想要的数据。类似很多转录调控数据库也是在ENCODE数据库获得目标原始数据后,进行分析后构建的自己数据库。

 

 

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