大家好，又见面了，我是你们的朋友全栈君。
算法实现
一：本文要结合SVM理论部分来看即笔者另一篇svm原理详细推导_爱吃火锅的博客-CSDN博客_svm推导
二：有了理论部分下面就是直接代码啦，本文用四部分进行介绍：最简版的SMO，改进版platt SMO，核函数，sklearn库的SVM，四部分以%%%%%%%分开，采取的顺序是先给代码及结果，然后分析
三：这里代码大部分来自于Peter Harrington编写的Machine Learning in Action
其网络资源Manning | Machine Learning in Action
四：代码中需要注意的一点就是采用启发式来寻找需要优化的
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
首先看一下最简版的smo优化算法：
这里有两个py文件，一个是用来构造SVM的，一个是用来测试的：
MySVM:
# -*- coding: utf-8 -*-
import random
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
#辅助函数一
def selectJrand(i, m):
j = i
while (j == i):
j = int(random.uniform(0, m))
return j
#辅助函函数二
def clipAlpha(aj,H,L):
if aj > H:
aj = H
if L > aj:
aj = L
return aj
#最简版本SMO算法
def smoSimple(dataMatIn, classLabels, C, toler, maxIter):
dataMatrix = np.mat(dataMatIn);
labelMat = np.mat(classLabels).transpose()
b = 0;
m,n = np.shape(dataMatrix)
alphas = np.mat(np.zeros((m,1)))
iter_num = 0
while (iter_num < maxIter):
alphaPairsChanged = 0
for i in range(m):
#注意一
fXi = float(np.multiply(alphas,labelMat).T*(dataMatrix*dataMatrix[i,:].T)) + b
Ei = fXi - float(labelMat[i])
if ((labelMat[i]*Ei < -toler) and (alphas[i] < C)) or ((labelMat[i]*Ei > toler) and (alphas[i] > 0)):
j = selectJrand(i,m)
fXj = float(np.multiply(alphas,labelMat).T*(dataMatrix*dataMatrix[j,:].T)) + b
Ej = fXj - float(labelMat[j])
alphaIold = alphas[i].copy();
alphaJold = alphas[j].copy();
if (labelMat[i] != labelMat[j]):
L = max(0, alphas[j] - alphas[i])
H = min(C, C + alphas[j] - alphas[i])
else:
L = max(0, alphas[j] + alphas[i] - C)
H = min(C, alphas[j] + alphas[i])
if L==H:
print("L==H");
continue
#注意二
eta = 2.0 * dataMatrix[i,:]*dataMatrix[j,:].T - dataMatrix[i,:]*dataMatrix[i,:].T - dataMatrix[j,:]*dataMatrix[j,:].T
if eta >= 0:
print("eta>=0");
continue
alphas[j] -= labelMat[j]*(Ei - Ej)/eta
alphas[j] = clipAlpha(alphas[j],H,L)
if (abs(alphas[j] - alphaJold) < 0.00001): print("alpha_j变化小，不需要更新"); continue
#注意三
alphas[i] += labelMat[j]*labelMat[i]*(alphaJold - alphas[j])
#注意四
b1 = b - Ei- labelMat[i]*(alphas[i]-alphaIold)*dataMatrix[i,:]*dataMatrix[i,:].T - labelMat[j]*(alphas[j]-alphaJold)*dataMatrix[i,:]*dataMatrix[j,:].T
b2 = b - Ej- labelMat[i]*(alphas[i]-alphaIold)*dataMatrix[i,:]*dataMatrix[j,:].T - labelMat[j]*(alphas[j]-alphaJold)*dataMatrix[j,:]*dataMatrix[j,:].T
if (0 < alphas[i]) and (C > alphas[i]): b = b1
elif (0 < alphas[j]) and (C > alphas[j]): b = b2
else: b = (b1 + b2)/2.0
alphaPairsChanged += 1
print("第%d次迭代 样本:%d, alpha优化次数:%d" % (iter_num,i,alphaPairsChanged))
if (alphaPairsChanged == 0):
iter_num += 1
else: iter_num = 0
print("迭代次数: %d" % iter_num)
#注意五
return b,alphas
def calcWs(dataMat, labelMat, alphas):
alphas, dataMat, labelMat = np.array(alphas), np.array(dataMat), np.array(labelMat)
w = np.dot((np.tile(labelMat.reshape(1, -1).T, (1, 2)) * dataMat).T, alphas)
return w.tolist()
def showClassifer(dataMat,labelMat,alphas, w, b):
data_plus = []
data_minus = []
#注意六
for i in range(len(dataMat)):
if labelMat[i] > 0:
data_plus.append(dataMat[i])
else:
data_minus.append(dataMat[i])
data_plus_np = np.array(data_plus)
data_minus_np = np.array(data_minus)
plt.scatter(np.transpose(data_plus_np)[0], np.transpose(data_plus_np)[1], s=30, alpha=0.7)
plt.scatter(np.transpose(data_minus_np)[0], np.transpose(data_minus_np)[1], s=30, alpha=0.7)
#注意七
x1 = max(dataMat)[0]
x2 = min(dataMat)[0]
a1, a2 = w
b = float(b)
a1 = float(a1[0])
a2 = float(a2[0])
y1, y2 = (-b- a1*x1)/a2, (-b - a1*x2)/a2
plt.plot([x1, x2], [y1, y2])
#注意八
for i, alpha in enumerate(alphas):
if 0.6>abs(alpha) > 0:
x, y = dataMat[i]
plt.scatter([x], [y], s=150, c='none', alpha=0.7, linewidth=1.5, edgecolor='red')
if 0.6==abs(alpha) :
x, y = dataMat[i]
plt.scatter([x], [y], s=150, c='none', alpha=0.7, linewidth=1.5, edgecolor='yellow')
plt.show()
接着是测试函数（MyTest）：
# -*- coding: utf-8 -*-#
import MySVM as svm
x=[[1,8],[3,20],[1,15],[3,35],[5,35],[4,40],[7,80],[6,49],[1.5,25],[3.5,45],[4.5,50],[6.5,15],[5.5,20],[5.8,74],[2.5,5]]
y=[1,1,-1,-1,1,-1,-1,1,-1,-1,-1,1,1,-1,1]
b,alphas = svm.smoSimple(x,y,0.6,0.001,40)
w = svm.calcWs(x,y,alphas)
svm.showClassifer(x,y,alphas, w, b)运行结果：
，，，，，，，，，，，，，
接下来一步步分析MySVM中的代码
首次看两个简单的辅助函数，第一个函数的作用就是用来选择对的（即寻找i，j这一对）
第二个函数就是为了将规划到[0,C]范围内，对应到理论推导部分的：
可能这里和上篇最后给出w的更新形式上看上去有点不对应，其实是一样的，推导部分即最后一张图是：
而这里的其实在程序就是对应的就是如下三步：
fXi = float(np.multiply(alphas,labelMat).T*(dataMatrix*dataMatrix[i,:].T)) + b
alphas[j] -= labelMat[j]*(Ei - Ej)/eta
alphas[i] += labelMat[j]*labelMat[i]*(alphaJold - alphas[j])
紧接着的if这里就是启发式选择，即寻找那些误差过大（正间隔和否间隔）且在（0，C）范围内的进行优化，选择误差大的进行优化我们很容易理解，那为什么要选择（0，C）范围内，而不选择边界值呢（值等于0或C），那是因为它们已经在边界啦，因此不再能够减少或者增大具体细节请看推导部分，该部分包括L和H为什么要这样赋值，以及为什么L==H的时候要返回都有讲到。
注意二的部分就是类似我们在推导部分的更新，只不过这里有一步如果变化太小我们就不更新了，直接跳过，只不过原公式中的，所以推导中原本是加上后面的，而这里是减即：本质是一样的啦，当然更新方向要相反，所以代码中对应的是+
alphas[j] -= labelMat[j]*(Ei - Ej)/eta至于为什么eta >= 0为什么要跳过该次循环，请看推导部分，只不过因为所以原来是过滤掉<=0,这里是>=0
注意三部分就是类似的更新即大小和相同，方向相反
注意四的部分应该很直观啦，看我们推导的b的更新结论一目了然
注意五返回的b是一个实数，alphas是一个[m,1]矩阵
最后说一下smo函数的alphaPairsChanged和iter_num以及maxIter的参数意义，maxIter是最外部的大循环，是人为设定的最大循环次数，循环为最大次数后就强行结束返回，在每一个大循环下都有一个for循环，用以遍历一遍所有的，遍历完这一遍所有的后，alphaPairsChange用以记录看有多少对被优化啦，如果alphaPairsChange不为0，即这一遍走下来后，我们进行了优化，也就代表目前还不够好，所以我们将iter_num设为0，继续优化，当alphaPairsChange为0时，说明我们这一遍走下来，说明都很好啦，没有优化的必要啦，我们将iter_num加一，接着下一遍再去整体看看，如果还是alphaPairsChange为0，恩恩，不错，不错，将iter_num再加一，如果iter_num到了maxIter即连续进行了maxIter遍整体（for）观察都没发现需要优化的，说明足够好了，返回吧！！！！！！一旦中间出现意外，发现有需要优化的，就至少说明有不完善的地方，那么我们立马让iter_num为0，即一定要达到连续遍历maxIter次都没发现不足，我们才放心，才返回，发现瑕疵立马iter_num=0从头开始，怎么样？就是这么严格，这也是上面运行结果开始的时候为什么迭代次数一直都是0，后面趋于收敛，迭代次数连续增加，直到maxIter结束返回
正是因为如此，可以想象得的到带来的结果就是 时间复杂度太高，所以有了后来改进版本的Platt SMO，后面介绍
接下来的calcWs函数作用是:根据训练出来的生成w：
对应的公式就是：
目前我们已经训练除了SVM模型，即得到了我们想要的w和b，对应的步骤就在上面所说的黄色部分
接下来可视化看一下结果showClassifer：
注意六的部分就是我们把原始点画出来，不同的颜色代表不同的分离（橙色的点对应的标签是-1，蓝色的点对应的标签是1）
注意七的部分就是画出训练出来的超平面
y1, y2 = (-b- a1*x1)/a2, (-b - a1*x2)/a2这个很好理解啦，超平面是：
所以：
程序中为了让超平面尽可能的横穿整个数据点，所以选取了所有点中x坐标最大和最小的点即x1和x2：
然后利用上面的公式，计算出了对应的纵坐标
注意八的部分就是画出向量机点，和那些我们“忽略”的点，依据是推导的：
即在点在两条间隔线外则，对应前面的系数为0，在两条间隔线里面的对应的系数为C，在两条间隔线上的点对应的系数在0和C之间。至于为什么请看上篇的推导细节
带有红色圆圈的是支持向量机点即间隔线上的点，带有黄色的点是间隔线内的点
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
Platt SMO：
其是SMO算法的一个改进版，速度更快。
其主要变化的地方有两个
一：在使用启发式方法选择了一个后，我们会去选择另外一个与之对应是吧，即
j = selectJrand(i,m)但是改进的的SMO算法中，这里也使用启发式来选择，即选择与Ei误差最大的Ej即选择最大步长，简单来说就是找最需要优化的j,而不是像最简版本那样，毫无目的的随机去选择，所以对应到推导公式里面就是和都采用启发式来寻找
二：改进后的算法是采用在“非边界值”和“边界值”范围内交替遍历优化的
下面来看一下具体代码：
smoP：
# -*- coding: utf-8 -*-
from numpy import *
import matplotlib.pyplot as plt
import random
def loadDataSet(filename):
dataMat=[]
labelMat=[]
fr=open(filename)
for line in fr.readlines():
lineArr=line.strip().split('\t')
dataMat.append([float(lineArr[0]),float(lineArr[1])])
labelMat.append(float(lineArr[2]))
return dataMat,labelMat
class optStruct:
def __init__(self,dataMatIn, classLabels, C, toler, kTup):
self.X = dataMatIn
self.labelMat = classLabels
self.C = C
self.tol = toler
self.m = shape(dataMatIn)[0]
self.alphas = mat(zeros((self.m,1)))
self.b = 0
self.eCache = mat(zeros((self.m,2)))
def selectJrand(i,m):
j=i
while (j==i):
j=int(random.uniform(0,m))
return j
def clipAlpha(aj,H,L):
if aj>H:
aj=H
if L>aj:
aj=L
return aj
def calcEk(oS, k):
fXk = float(multiply(oS.alphas,oS.labelMat).T*(oS.X*oS.X[k,:].T) + oS.b)
Ek = fXk - float(oS.labelMat[k])
return Ek
def selectJ(i, oS, Ei):
maxK = -1
maxDeltaE = 0
Ej = 0
oS.eCache[i] = [1,Ei]
validEcacheList = nonzero(oS.eCache[:,0].A)[0]
if (len(validEcacheList)) > 1:
for k in validEcacheList:
if k == i:
continue
Ek = calcEk(oS, k)
deltaE = abs(Ei - Ek)
if (deltaE > maxDeltaE):
maxK = k
maxDeltaE = deltaE
Ej = Ek
return maxK, Ej
else:
j = selectJrand(i, oS.m)
Ej = calcEk(oS, j)
return j, Ej
def updateEk(oS, k):
Ek = calcEk(oS, k)
oS.eCache[k] = [1,Ek]
def innerL(i, oS):
Ei = calcEk(oS, i)
if ((oS.labelMat[i]*Ei < -oS.tol) and (oS.alphas[i] < oS.C)) or ((oS.labelMat[i]*Ei > oS.tol) and (oS.alphas[i] > 0)):
j,Ej = selectJ(i, oS, Ei)
alphaIold = oS.alphas[i].copy()
alphaJold = oS.alphas[j].copy()
if (oS.labelMat[i] != oS.labelMat[j]):
L = max(0, oS.alphas[j] - oS.alphas[i])
H = min(oS.C, oS.C + oS.alphas[j] - oS.alphas[i])
else:
L = max(0, oS.alphas[j] + oS.alphas[i] - oS.C)
H = min(oS.C, oS.alphas[j] + oS.alphas[i])
if L==H:
print("L==H")
return 0
eta = 2.0 * oS.X[i,:]*oS.X[j,:].T-oS.X[i,:]*oS.X[i,:].T-oS.X[j,:]*oS.X[j,:].T
if eta >= 0:
print("eta>=0")
return 0
oS.alphas[j] -= oS.labelMat[j]*(Ei - Ej)/eta
oS.alphas[j] = clipAlpha(oS.alphas[j],H,L)
updateEk(oS, j)
if (abs(oS.alphas[j] - alphaJold) < oS.tol):
print("j not moving enough")
return 0
oS.alphas[i] += oS.labelMat[j]*oS.labelMat[i]*(alphaJold - oS.alphas[j])
updateEk(oS, i)
b1 = oS.b - Ei- oS.labelMat[i]*(oS.alphas[i]-alphaIold)*oS.X[i,:]*oS.X[i,:].T - oS.labelMat[j]*(oS.alphas[j]-alphaJold)*oS.X[i,:]*oS.X[j,:].T
b2 = oS.b - Ej- oS.labelMat[i]*(oS.alphas[i]-alphaIold)*oS.X[i,:]*oS.X[j,:].T - oS.labelMat[j]*(oS.alphas[j]-alphaJold)*oS.X[j,:]*oS.X[j,:].T
if (0 < oS.alphas[i]<oS.C):
oS.b = b1
elif (0 < oS.alphas[j]<oS.C):
oS.b = b2
else:
oS.b = (b1 + b2)/2.0
return 1
else:
return 0
def calcWs(dataMat, labelMat, alphas):
alphas, dataMat, labelMat = array(alphas), array(dataMat), array(labelMat)
w = dot((tile(labelMat.reshape(1, -1).T, (1, 2)) * dataMat).T, alphas)
return w.tolist()
def smoP(dataMatIn, classLabels, C, toler, maxIter,kTup=('lin', 0)):
oS = optStruct(mat(dataMatIn),mat(classLabels).transpose(),C,toler, kTup)
iter = 0
entireSet = True
alphaPairsChanged = 0
while (iter < maxIter) and ((alphaPairsChanged > 0) or (entireSet)):
alphaPairsChanged = 0
if entireSet:
for i in range(oS.m):
alphaPairsChanged += innerL(i,oS)
print("fullSet, iter: %d i:%d, pairs changed %d" % (iter,i,alphaPairsChanged))
iter += 1
else:
nonBoundIs = nonzero((oS.alphas.A > 0) * (oS.alphas.A < C))[0]
for i in nonBoundIs:
alphaPairsChanged += innerL(i,oS)
print("non-bound, iter: %d i:%d, pairs changed %d" % (iter,i,alphaPairsChanged))
iter += 1
if entireSet:
entireSet = False
elif (alphaPairsChanged == 0):
entireSet = True
print("iteration number: %d" % iter)
return oS.b,oS.alphas
def showClassifer(dataMat,labelMat,alphas, w, b):
data_plus = []
data_minus = []
for i in range(len(dataMat)):
if labelMat[i] > 0:
data_plus.append(dataMat[i])
else:
data_minus.append(dataMat[i])
data_plus_np = array(data_plus)
data_minus_np = array(data_minus)
plt.scatter(transpose(data_plus_np)[0], transpose(data_plus_np)[1], s=30, alpha=0.7)
plt.scatter(transpose(data_minus_np)[0], transpose(data_minus_np)[1], s=30, alpha=0.7)
x1 = max(dataMat)[0]
x2 = min(dataMat)[0]
a1, a2 = w
b = float(b)
a1 = float(a1[0])
a2 = float(a2[0])
y1, y2 = (-b- a1*x1)/a2, (-b - a1*x2)/a2
plt.plot([x1, x2], [y1, y2])
for i, alpha in enumerate(alphas):
if 0.6>abs(alpha) > 0:
x, y = dataMat[i]
plt.scatter([x], [y], s=150, c='none', alpha=0.7, linewidth=1.5, edgecolor='red')
if 50==abs(alpha) :
x, y = dataMat[i]
plt.scatter([x], [y], s=150, c='none', alpha=0.7, linewidth=1.5, edgecolor='yellow')
plt.show()
接着还是测试函数（MyTest）：
# -*- coding: utf-8 -*-#
import smoP as svm
x=[[1,8],[3,20],[1,15],[3,35],[5,35],[4,40],[7,80],[6,49],[1.5,25],[3.5,45],[4.5,50],[6.5,15],[5.5,20],[5.8,74],[2.5,5]]
y=[1,1,-1,-1,1,-1,-1,1,-1,-1,-1,1,1,-1,1]
b,alphas = svm.smoP(x,y,50,0.001,40)
w = svm.calcWs(x,y,alphas)
svm.showClassifer(x,y,alphas, w, b)
，，，，，，，，，，，
这里首先optStruct函数定义了一个类作为数据结构来存储一些信息，这里面的alphas就是我们的，eCache第一列就是一个是否有效的标志位，第二列存储着误差值E，总之这个结构体的定义就是为了作为一个整体，方便调用，管理。
calcEk和最简版本没什么差别，只不过我们已经定义了结构体，所以直接可以调用结构体便可得到一些信息，所以下面所有代码都是这样，比如C我们可以直接用oS.C等等
selectJ和最简版本不一样啦，这里也就是我们说的用启发式来寻找j,这里的：
if (len(validEcacheList)) > 1:主要是防止第一次循环的时候，如果是第一次那么就随机选择，之后都使用启发式来选择
updateEk就是用来在计算完i和j的Ei和Ej后更新数据结构中的的eCache
innerL和最简版本的smoSimple内循环（就是for循环下面的代码：用来优化和b的核心代码）一模一样，只不过这里要把一些东西，改为数据结构中定义的，而且这里的selectJ已经采用了启发式寻找
接下来就是我们的smoP，也是Platt SMO利用主循环封装整个算法的过程，其和最简版本一样，也是两个循环：
外训练也是使用了一个maxIter，同时使用了iter来记录遍历次数（对应最简版本的iter_num）,但是两者含义却不一样，这里的iter就是单纯的代表一次循环，而不管循环内部具体做了什么，它没有被清0这个过程，随着程序运行一直是个累加的过程，上面运行结果也可以看到iter是一直递增的，这也是Platt SMO之所以能够加快算法的一个重要原因，而最简版本的iter_num要肩负着连续这一条件，同时这里的外循环相对于最简版本的的外循环多了一个退出条件即：遍历整个集合都没发现需要改变的（说明都优化好啦，退出吧）
再来看一下内循环，这里对应着两种情况，一种是在全集上面遍历（[0,C]），另一种是非边界上面（（0，C）），通过
if entireSet:
entireSet = False
elif (alphaPairsChanged == 0):
entireSet = True使两种情况交替遍历
其他部分包括W的获得，可视化什么的就和最简版本一样啦，不再重复介绍啦
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
核函数
核函数的作用细节请看推导部分，核函数种类很多，这里看一下最常用的径向基高斯（RBF）核函数
下面来简单说一下部分代码（这里只说不同的地方，相同的地方不再重述）
# -*- coding: utf-8 -*-
from numpy import *
import matplotlib.pyplot as plt
def loadDataSet(filename):
dataMat=[]
labelMat=[]
fr=open(filename)
for line in fr.readlines():
lineArr=line.strip().split(',')
dataMat.append([float(lineArr[0]),float(lineArr[1])])
labelMat.append(float(lineArr[2]))
return dataMat,labelMat
def selectJrand(i,m):
j=i
while (j==i):
j=int(random.uniform(0,m))
return j
def clipAlpha(aj,H,L):
if aj>H:
aj=H
if L>aj:
aj=L
return aj
def kernelTrans(X, A, kTup):
m,n = shape(X)
K = mat(zeros((m,1)))
if kTup[0]=='lin':
K = X * A.T
elif kTup[0]=='rbf':
for j in range(m):
deltaRow = X[j,:] - A
K[j] = deltaRow*deltaRow.T
K = exp(K/(-1*kTup[1]**2))
else:
raise NameError('Houston We Have a Problem -- That Kernel is not recognized')
return K
class optStruct:
def __init__(self,dataMatIn, classLabels, C, toler, kTup):
self.X = dataMatIn
self.labelMat = classLabels
self.C = C
self.tol = toler
self.m = shape(dataMatIn)[0]
self.alphas = mat(zeros((self.m,1)))
self.b = 0
self.eCache = mat(zeros((self.m,2)))
self.K = mat(zeros((self.m,self.m)))
for i in range(self.m):
self.K[:,i] = kernelTrans(self.X, self.X[i,:], kTup)
def calcEk(oS, k):
fXk = float(multiply(oS.alphas,oS.labelMat).T*oS.K[:,k] + oS.b)
Ek = fXk - float(oS.labelMat[k])
return Ek
def selectJ(i, oS, Ei):
maxK = -1
maxDeltaE = 0
Ej = 0
oS.eCache[i] = [1,Ei]
validEcacheList = nonzero(oS.eCache[:,0].A)[0]
if (len(validEcacheList)) > 1:
for k in validEcacheList:
if k == i:
continue
Ek = calcEk(oS, k)
deltaE = abs(Ei - Ek)
if (deltaE > maxDeltaE):
maxK = k
maxDeltaE = deltaE
Ej = Ek
return maxK, Ej
else:
j = selectJrand(i, oS.m)
Ej = calcEk(oS, j)
return j, Ej
def updateEk(oS, k):
Ek = calcEk(oS, k)
oS.eCache[k] = [1,Ek]
def innerL(i, oS):
Ei = calcEk(oS, i)
if ((oS.labelMat[i]*Ei < -oS.tol) and (oS.alphas[i] < oS.C)) or ((oS.labelMat[i]*Ei > oS.tol) and (oS.alphas[i] > 0)):
j,Ej = selectJ(i, oS, Ei)
alphaIold = oS.alphas[i].copy()
alphaJold = oS.alphas[j].copy()
if (oS.labelMat[i] != oS.labelMat[j]):
L = max(0, oS.alphas[j] - oS.alphas[i])
H = min(oS.C, oS.C + oS.alphas[j] - oS.alphas[i])
else:
L = max(0, oS.alphas[j] + oS.alphas[i] - oS.C)
H = min(oS.C, oS.alphas[j] + oS.alphas[i])
if L==H:
print("L==H")
return 0
eta = 2.0 * oS.K[i,j] - oS.K[i,i] - oS.K[j,j]
if eta >= 0:
print("eta>=0")
return 0
oS.alphas[j] -= oS.labelMat[j]*(Ei - Ej)/eta
oS.alphas[j] = clipAlpha(oS.alphas[j],H,L)
updateEk(oS, j)
if (abs(oS.alphas[j] - alphaJold) < oS.tol):
print("j not moving enough")
return 0
oS.alphas[i] += oS.labelMat[j]*oS.labelMat[i]*(alphaJold - oS.alphas[j])
updateEk(oS, i)
b1 = oS.b - Ei- oS.labelMat[i]*(oS.alphas[i]-alphaIold)*oS.K[i,i] - oS.labelMat[j]*(oS.alphas[j]-alphaJold)*oS.K[i,j]
b2 = oS.b - Ej- oS.labelMat[i]*(oS.alphas[i]-alphaIold)*oS.K[i,j]- oS.labelMat[j]*(oS.alphas[j]-alphaJold)*oS.K[j,j]
if (0 < oS.alphas[i]<oS.C):
oS.b = b1
elif (0 < oS.alphas[j]<oS.C):
oS.b = b2
else:
oS.b = (b1 + b2)/2.0
return 1
else:
return 0
def smoP(dataMatIn, classLabels, C, toler, maxIter,kTup=('lin', 0)):
oS = optStruct(mat(dataMatIn),mat(classLabels).transpose(),C,toler, kTup)
iter = 0
entireSet = True
alphaPairsChanged = 0
while (iter < maxIter) and ((alphaPairsChanged > 0) or (entireSet)):
alphaPairsChanged = 0
if entireSet:
for i in range(oS.m):
alphaPairsChanged += innerL(i,oS)
print("fullSet, iter: %d i:%d, pairs changed %d" % (iter,i,alphaPairsChanged))
iter += 1
else:
nonBoundIs = nonzero((oS.alphas.A > 0) * (oS.alphas.A < C))[0]
for i in nonBoundIs:
alphaPairsChanged += innerL(i,oS)
print("non-bound, iter: %d i:%d, pairs changed %d" % (iter,i,alphaPairsChanged))
iter += 1
if entireSet:
entireSet = False
elif (alphaPairsChanged == 0):
entireSet = True
print("iteration number: %d" % iter)
return oS.b,oS.alphas
def testRbf(data_train,data_test):
dataArr,labelArr = loadDataSet(data_train)
b,alphas = smoP(dataArr, labelArr, 200, 0.0001, 10000, ('rbf', 0.2))
datMat=mat(dataArr)
labelMat = mat(labelArr).transpose()
svInd=nonzero(alphas)[0]
sVs=datMat[svInd]
labelSV = labelMat[svInd]
print("there are %d Support Vectors" % shape(sVs)[0])
m,n = shape(datMat)
errorCount = 0
for i in range(m):
kernelEval = kernelTrans(sVs,datMat[i,:],('rbf', 1.3))
predict=kernelEval.T * multiply(labelSV,alphas[svInd]) + b
if sign(predict)!=sign(labelArr[i]):
errorCount += 1
print("the training error rate is: %f" % (float(errorCount)/m))
dataArr_test,labelArr_test = loadDataSet(data_test)
errorCount_test = 0
datMat_test=mat(dataArr_test)
labelMat = mat(labelArr_test).transpose()
m,n = shape(datMat_test)
for i in range(m):
kernelEval = kernelTrans(sVs,datMat_test[i,:],('rbf', 0.1))
predict=kernelEval.T * multiply(labelSV,alphas[svInd]) + b
if sign(predict)!=sign(labelArr_test[i]):
errorCount_test += 1
print("the test error rate is: %f" % (float(errorCount_test)/m))
return dataArr,labelArr,alphas
def showClassifer(dataMat,labelMat,alphas):
data_plus = []
data_minus = []
for i in range(len(dataMat)):
if labelMat[i] > 0:
data_plus.append(dataMat[i])
else:
data_minus.append(dataMat[i])
data_plus_np = array(data_plus)
data_minus_np = array(data_minus)
plt.scatter(transpose(data_plus_np)[0], transpose(data_plus_np)[1], s=30, alpha=0.7)
plt.scatter(transpose(data_minus_np)[0], transpose(data_minus_np)[1], s=30, alpha=0.7)
for i, alpha in enumerate(alphas):
if abs(alpha) > 0:
x, y = dataMat[i]
plt.scatter([x], [y], s=150, c='none', alpha=0.7, linewidth=1.5, edgecolor='red')
plt.show()
MyTest:
# -*- coding: utf-8 -*-
import smoPrbf as svm
traindata='C:\\Users\\asus-\\Desktop\\train_data.csv'
testdata='C:\\Users\\asus-\\Desktop\\test_data.csv'
TraindataArr,TrainlabelArr,alphas = svm.testRbf(traindata,testdata)
svm.showClassifer(TraindataArr,TrainlabelArr,alphas)当时：
当时：
kernelTrans函数的作用就是核函数的计算部分，对应到推导公式是：
这里的kTup就是指定使用什么核函数，kTup[0]参数是核函数类型，kTup[1]是核函数需要的超参数，注意这里只支持线性和径向基高斯（RBF）核函数 两种.
optStruct函数增加了一个字段即K，其是一个m*m的矩阵。注意它的含义：
我们的核函数是即拿来一个点x，要和所有样本做运算，这里的行代表的意义就是所有样本，列代表的是x所以这里是：
elf.K[:,i] = kernelTrans(self.X, self.X[i,:], kTup)innerL变化的部分是：
eta = 2.0 * oS.K[i,j] - oS.K[i,i] - oS.K[j,j]对比之前的：
eta = 2.0 * oS.X[i,:]*oS.X[j,:].T-oS.X[i,:]*oS.X[i,:].T-oS.X[j,:]*oS.X[j,:].T就可以更好的理解为什么在optStruct结构体中K字段要这么设计
同理变化的地方还有：
b1 = oS.b - Ei- oS.labelMat[i]*(oS.alphas[i]-alphaIold)*oS.K[i,i] - oS.labelMat[j]*(oS.alphas[j]-alphaJold)*oS.K[i,j]
b2 = oS.b - Ej- oS.labelMat[i]*(oS.alphas[i]-alphaIold)*oS.K[i,j]- oS.labelMat[j]*(oS.alphas[j]-alphaJold)*oS.K[j,j]calcEk变化的地方：
fXk = float(multiply(oS.alphas,oS.labelMat).T*oS.K[:,k] + oS.b)简单来说就是原先有的地方都要换成核函数的内积形式即
注意这里在通过构建权重w时是只用到是支持向量机那些点即