大家好,又见面了,我是你们的朋友全栈君。
解螺旋·蘑菇老师详细讲解biomarker研究在课题设计方面需要注意的一些共性问题,包括标本类型、样本收集以及病例资料三大部分。
本期课程则汇总了biomarker研究中的典型图表以形成”图表九宫格“,并着重讲解有关biomarker表达差异(基础表达和变化趋势)、诊断标志(ROC曲线和四格表)的相关图表;
同时,依据模拟数据,实操演示Graphpad、SPSS软件制作相关图表的具体步骤,学员们可按照课程讲解步骤将实际研究数据快速出图。
一,大家在制作biomarker研究图表时,需要先了解所投期刊对文章的要求,而后依据作图的三大原则(视觉区分、色彩搭配和对称平衡)直接生成符合要求的图片和文件,省去后续处理的麻烦。
课程则详细讲解了Biomarker筛选的分子类型和”筛猜“策略。
二,通常biomarker的表达差异图可分为两大类,一类针对不同的个体的分子表达差异,包括柱状图、箱式图和散点图;
一类针对同一个体,如治疗前后的分子表达差异,或肿瘤和癌旁组织的表达差异,这些数据多是用趋势图来表示的。
因Graphpad在录入数据后可对数据的呈现方式进行相应的调整,则针对上述四类图型只要掌握了其中一种,其他触类旁通、举一反三即可。
课程实例演示了柱状图和独立t检验的具体操作方法。
1.柱状图
2.独立t检验
三,当Biomarker研究涉及到诊断的意义时,还要再引入一个数据图——ROC曲线图。
该图是用来评估一种检测方法与另一种金标准的检测方法之间敏感性和特异性的差别,可表征一种新的诊断方法与传统的策略相比诊断效能如何。
同样课程以模拟数据为例,演示了如何通过SPSS软件绘制ROC曲线的具体方法。
四,临床诊断型实验指的是判断罹患疾病的检测方法,包括实验室检测法和影像学方法,目的是辅助诊断和筛查体验。
不论是研究新的诊断标准,还是实验室指标对疾病的诊断价值,或是对预后的诊断,均涉及到试验的阳性与阴性、标准诊断的某病与非某病四种情况,因此要用四格表进行运算。
同样,课程以一个模拟案例,也介绍了四格表计算的在线绘制方法和Excel表格绘制法。
1.在线操作法
2.Excel实操法
作者:子非鱼
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