用 VIF 方法消除多维数据中的多重共线性

用 VIF 方法消除多维数据中的多重共线性多元线性回归是我们在数据分析中经常用到的一个方法,很多人在遇到多维数据时基本上无脑使用该方法,而在用多元线性回归之后所得到的结果又并不总是完美的,其问题实际上并不出在方法上,而是出在数据…

大家好,又见面了,我是你们的朋友全栈君。

用 VIF 方法消除多维数据中的多重共线性

多元线性回归是我们在数据分析中经常用到的一个方法,很多人在遇到多维数据时基本上无脑使用该方法,而在用多元线性回归之后所得到的结果又并不总是完美的,其问题实际上并不出在方法上,而是出在数据上。当数据涉及的维度过多时,我们就很难保证维度之间互不相关,而这些维度又都对结果产生一定影响,当一组维度或者变量之间有较强的相关性时,就认为是一种违背多元线性回归模型基本假设的情形。今天我们就讲解一下如何用VIF方法消除多维数据中多重共线性的问题。

首先介绍一下多重共线性。

多元回归模型有一个基本假设,就是要求设计矩阵X的秩rank(X)=p+1,其中p是维度数,即要求X中的列向量之间线性无关。如果存在不全为零的p+1个数c0、c1、c2、...、cp,使得c0 + c1xi1 + c2xi2 + ... + cpxip = 0i=1, 2, 3, ..., n,则自变量x1、x2、...、xp之间存在多重共线性(multi-collinearity),因为实际问题中,完全多重共线性不太常见,所以上式中的等号经常用约等号。多重共线性到底会带来什么问题呢,笔者下面就用一个实际例子来告诉大家。

这个例子来自1994年统计摘要,是一个中国民航客运量的回归模型,统计了1978至1993年的各年数据。该模型以民航客运量为因变量y,以国民收入、消费额、民航航线里程、来华旅游入境人数作为影响客运量的主要因素,其中y的单位是万人,x1表示国民收入(亿元),x2表示消费额(亿元),x3表示铁路客运量(万人),x4表示民航航线里程(万公里),x5表示来华旅游入境人数(万人)。该数据集如图1所示,一共16行、7列(包括前面的year,虽然这一列用不到)。

用 VIF 方法消除多维数据中的多重共线性

图1. 数据集截图

我们用该数据集来做一个多元线性回归模型,主要使用statsmodels,代码如下。首先是导入各种库。

import numpy as np
import pandas as pd
import statsmodels.api as sm
from statsmodels.stats.outliers_influence import variance_inflation_factor

接下来是读取数据,并生成自变量X和因变量y

file = r'C:\Users\Desktop\data.xlsx'
data = pd.read_excel(file) #读取数据
y = data['y'] #因变量数据
X = data.loc[:, 'x1':] #自变量数据

然后是生成多元回归模型,并输出结果,结果如图2所示。

X = sm.add_constant(X) #加上一列常数1,这是回归模型中的常数项
reg = sm.OLS(y, X) #生成回归模型
model = reg.fit() #拟合数据
model.summary() #生成结果

用 VIF 方法消除多维数据中的多重共线性

图2. 原数据的多元回归模型结果

图2中的参数较多,如果大家对这个结果不太明白,可以参考笔者之前给公众号写的文章《详解用statsmodels进行回归分析》。从图2中可以得出,我们的模型的回归方程为y = 450.9 + 0.354x1 - 0.561x2 - 0.0073x3 + 21.578x4 + 0.435x5,看到这里,估计很多人就看出一些问题了。这个回归模型从表面上看没有什么太大的问题,但是仔细分析一下其实际意义,就能看出一些问题,x2是消费额,从经济学角度分析,消费额与民航客运量之间的关系应该是正相关的,也就是x2前面的系数应该是正的,但这里却是负值,问题出在哪?这就是变量之间的多重共线性造成的。

多重共线性的影响就在于此,我们的模型结果中每一个参数都能通过检验,而且模型整体的线性显著性也很好(比如该例中R-squared值为0.998,效果非常好),但其部分参数的实际意义却和我们的常识是相违背的,而这种情况我们往往很难察觉,很多人看到自己的模型在数学角度上没有任何问题,就直接拿去用了,结果总是得到错误的结论。

那么如何来诊断多重共线性呢?笔者今天就介绍一下VIF方法。VIF全称是Variance Inflation Factor,即方差扩大因子,我们对自变量X作中心标准化,则X变为Xs,然后可以得到Xs’ Xs = (rij),这个就是自变量的相关阵。如图3所示,式(1)中C的主对角线元素VIFj=cjj,就是自变量xj的方差扩大因子,式(2)中的Rj^2是自变量xj对其余p-1个自变量的复决定系数,式(2)也可以作为方差扩大因子VIFj的定义,可知VIFj是大于等于1的。

用 VIF 方法消除多维数据中的多重共线性

图3. VIF方法部分公式

Rj^2度量了自变量xj与其余p-1个自变量的线性相关程度,这种相关程度越强,说明自变量之间的多重共线性就越严重,Rj^2越接近1,VIFj就越大。反之,xj与其余p-1个自变量之间的线性相关程度越弱,多重共线性就越弱,Rj^2就越接近于0,VIFj就约接近于1。由此可见,VIFj的大小反映了自变量之间是否存在多重共线性,可由它来度量多重共线性的严重程度,那么VIFj多大才算是有严重的多重共线性呢?根据统计学中的使用经验,当VIFj大于等于10的时候,就说明自变量xj与其余自变量之间存在严重的多重共线性,且这种多重共线性会过度地影响最小二乘估计值。

在了解了VIF的概念之后,我们就用代码来展示一下如何诊断并消除多重共线性。这里笔者依然使用前面的数据,但加入了VIF检测,同时给出消除多重共线性后的结果,全部代码如下。

file = r'C:\Users\Desktop\data.xlsx'
data = pd.read_excel(file)
y = data['y']
X = data.loc[:, 'x1':]
X = sm.add_constant(X)

def process(data, col):
    data = data.loc[:, col] #读取对应列标数据
    vif = [variance_inflation_factor(data.values, i) for i in range(data.shape[1])][1:] 
    if max(vif) >= 10:
        index = np.argmax(vif)+1 #得到最大值的标号
        del col[index] #删除vif值最大的一项
        return process(data, col) #递归过程
    else:
        vif = [variance_inflation_factor(data.values, i) for i in range(data.shape[1])][1:]
        return col, vif
          
cols = ['const', 'x1', 'x2', 'x3', 'x4', 'x5']
cols, vif = process(X, cols)
reg = sm.OLS(y, X[cols])
model = reg.fit()
model.summary()

这里我们从process这个函数开始讲起,process需要两个参数,一个是data,就是要输入的数据,另一个是col,就是数据的columns(即数据的列标题),我们这里默认使用的数据集是pandas.DataFrame格式的,所以数据都是有columns的。在process函数中,data = data.loc[:, col]就是读取只含有col列标的那些数据, vif = [variance_inflation_factor(data.values, i) for i in range(data.shape[1])][1:]这行代码就是计算vif的过程,variance_inflation_factor函数需要输入两个参数,分别是数据和每列数据的标号,这个标号也是从0开始的。而最终我们取得的vif结果是去掉第一项的,因为第一项对应数据集中const那一列,这一列因为都是1,所以在vif结果中要去掉,但在计算时要保留。而得到vif之后,我们要找出vif中数据最大的一项,判断其是否大于等于10。如果是,就找到其对应的标号,利用np.argmax即可,然后删除col中这一项,再把所得的结果带入到process函数中,形成递归;如果不是,则直接返回colvif这两个结果。

最终我们得到的cols['const', 'x3', 'x4', 'x5']const就是前面X = sm.add_constant(X)中加入的常数项一列,这个const列标是自动添加的,我们在这里仍沿用这个叫法,这列数据在VIF方法中只参与计算,但其值不用于比较大小。我们可以看到这里的结果去掉了x1x2这两列数据,消除多重共线性最好的方式就是把那些造成多重共线性的维度(自变量)直接去掉,vif[1.9836946236748652, 6.6499090855830225, 8.513876170172715]vif中所有数值都在10以内,说明目前已经消除了多重共线性。

然后用剩下的这些数据进行建模,得到多元回归模型,其结果如图4所示。该模型为y = 591.9 - 0.0104x3 + 26.4358x4 + 0.3174x5,该模型无论从数学上还是经济意义上,都能合理有效地进行解释。

用 VIF 方法消除多维数据中的多重共线性

图4. 用VIF法处理后的模型结果

判断数据是否具有多重共线性实际上有多种方法,比如特征根判定法、直接判断法等,本文主要讲解如何用VIF法来诊断多重共线性,有兴趣的读者也可以把此方法和其他方法进行一下对比学习。

作者简介:Mort,数据分析爱好者,擅长数据可视化,比较关注机器学习领域,希望能和业内朋友多学习交流。

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