蛋白PDB文件格式[通俗易懂]

蛋白PDB文件格式[通俗易懂]列 数据类型字段名称 定义描述1-6 Recordname”DBREF”8-11IDcode idCode 记录的ID号13 Character

大家好,又见面了,我是你们的朋友全栈君。

列 

数据类型

字段名称 

定义描述

1 – 6 

Record name

“DBREF “

8 – 11

IDcode 

idCode 

记录的ID

13 

Character

chainID 

链的标识符

15 – 18 

Integer 

seqBegin 

PDB序列片段的起始序列号

19 

AChar 

insertBegin

PDB序列片段的起始插入代码

21 – 24 

Integer 

seqEnd

PDB序列片段的终止序列号

25 

AChar 

insertEnd 

PDB序列片段的终止插入代码

27 – 32 

LString

database

序列数据库名称如PDBSWS,当一个相应的序列数据库记录还未识别时即存放PDB

34 – 41 

LString

dbAccession 

序列数据库的访问号码,如对于GenBank来说即是NCBI gi

43 – 54 

LString

dbIdCode 

序列数据库的识别密码,对GB来说即是访问号码

56 – 60 

Integer 

dbseqBegin 

数据库片段的起始序列号

61 

AChar 

idbnsBeg 

涉及到PDB的话,存放片段起始残基的插入代码

63 – 67

Integer 

dbseqEnd 

数据库片段的终止序列号

68 

AChar 

dbinsEnd 

涉及到PDB的话,存放片段终止残基的插入代码。


原文出自:蛋白质PDB文件说明.doc

英文版:PDB Primary Structure Section


蛋白PDB文件格式



from:Valeri Barsegov Molecular Dynamics Simulations: Lecture 16 & 17

转自:http://blog.sina.com.cn/s/blog_6264e0aa0102edyr.html

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